زوترو به همراه قالب‌های مرجع‌دهی معروف برای درج مراجع و کتاب‌شناسی عرضه می‌شود ضمن اینکه بیش از 2800 قالب دیگر نیز در انبار قالب‌های زوترو موجود است. همۀ این قالب‌ها به زبان قالب مرجع‌دهی
نوشته شده‌اند. این زبان توسط برنامه‌های (CSL)
نیز پشتیبانی می‌شود Mendeley و Papers.

اگر از نسخه‌ی فایرفاکس زوترو استفاده می‌کنید، نصب یک قالب جدید از انبار قالب‌های زوترو به راحتی یک کلیک است! تنها کافیست بر روی نام قالب مورد نظر خود کلیک کنید.

اگر از نسخه‌ی مستقل زوترو استفاده می‌کنید نخست باید قالب مورد نظر را بر روی رایانه بارگذاری کنید. برای این کار بر روی قالب راست کلیک کرده و گزینه‌ی
را انتخاب کنید “Save Link as…“
آنگاه بر روی فایل دو بار کلیک کنید تا زوترو آن را نصب کند. می‌توانید به جای این کار از روش‌های جایگزین که در ادامه می‌آید استفاده کنید.

شما در قسمت انبار قالب‌ها می‌توانید قالب‌ها را بر اساس نام جستجو کنید. همچنین می‌توانید آنها را بر اساس نوع و رشته‌ی تحصیلی فیلتر کنید. اگر گزینه‌ی
“Show only unique styles”
را فعال کنید قالب‌های مشابهی که قالب‌بندی یکسانی دارند مخفی می‌شوند.. مثلاً قالب مجله‌های
و غیره “Nature”, “Nature Biotechnology”, “Nature Chemistry”
مشابه است و در این حالت قالب مستقل مجله یعنی
نمایش داده می‌شود “Nature”

همراهند را می‌توان “.csl” که با پسوند CSL قالب‌های
از مسیر زیر نیز به زوترو افزود
پنجره‌ی تنظیمات زوترو » “Cite” صفحه‌ی » “Styles” برگه‌ی» Style Manager
این پنجره به شما نشان می‌دهد چه قالب‌هایی تاکنون نصب شده‌اند. در همین پنجره می‌توانید قالب‌ها را حذف کنید. یک روش جایگزین دیگر برای نصب قالب‌ها در نسخه‌ی فایرفاکس زوترو، کشیدن و رها کردن
مربوط به قالب در پنجره‌ی زوترو است CLS فایل