در کتابخانۀ زوترو می‌توان اقلام را در قالب مجموعه‌ها و برچسب‌ها سازماندهی کرد.

“مجموعه‌ها” امکان ساماندهی سلسله مراتبی دسته‌ای از اقلام را پیش از افزودن آنها به کتابخانه فراهم می‌کنند. هر قلم می‌تواند در چندین محل (زیرمجموعه) مختلف در مجموعۀ کتابخانۀ شما قرار بگیرد. سپس می‌توان آنها را به صورت سلسله مراتبی و به سرعت بازیابی کرد.

“برچسب‌ها” (یا همان کلید‌واژه‌ها) امکان توصیف کردن ویژگی‌های بیشتری از یک قلم را فراهم می‌کنند. برچسب‌ها امکان ایجاد مجموعه‌های تخصصی‌تر را پس از افزودن اقلام به کتابخانه فراهم می‌کنند. (مثلاً می‌توان تمام اقلامی را که دارای کلید‌واژه‌های “تاریخ” + “ایران” هستند را جدا نمود.)

برچسب‌ها قابلیت جابجایی دارند اما مجموعه‌ها اینطور نیستند. کپی کردن اقلام مستقل میان کتابخانه‌های زوترو برچسب‌های آنها را نیز منتقل می‌کند اما مجموعه‌های آنها را منتقل نمی‌کند. هر دو این امکانات دارای ویژگی‌ها منحصر به فرد خود هستند. بهتر است مدتی با هر دو کار کنید تا ببینید کدامیک برای کار شما مناسبتر است.

راهنماهای تصویری
مجموعه‌ها
برچسب‌ها	جعبۀ انتخاب برچسب