Zotero verfügt über einige häufig benutzte Zitierstile, welche benutzt werden können um Literaturverzeichnisse zu erstellen sowie Quellenangaben im Text oder Fussnoten zu machen. Über 6750 weitere Zitierstile können im Zotero Style Repository gefunden werden. Diese Stille sind alle in der Citation Style Language (CSL) geschrieben und werden auch von Mendeley oder Papers unterstützt.