모바일 기기를 위한 Zotero의 공식 앱은 없지만 몇몇 third party 툴을 활용할 수 있다.

• ZotPad, by Mikko Rönkkö.
  • 아이패드에서 내 라이브러리와 첨부파일을 볼 수 있다.
• BibUp, by Centre NTE (Université de Fribourg).
  • 아이폰/아이패드로 ISBN 바코를 스캔하여 Zotero 라이브러리에 책을 아이템으로 추가할 수 있다.

• Zandy, by Avram Lyon.
  • 안드로이드 기기에서 내 라이브러리를 보거나 수정할 수 있다.
• Scanner for Zotero, by John M. Schanck.
  • 모바일 기기로 ISBN 바코드를 스캔하여 내 라이브러리에 책을 아이템으로 추가할 수 있다.

• Zotfile, by Joscha Legewie.
  • 내 라이브러리에서 아이패드, 갤럭시 탭 등의 모바일 PDF 리더로 PDF 파일을 동기화시키고 Zotero 노트로 주석을 발췌하는 플러그인이다.