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Les documents des bibliothèques Zotero peuvent être organisés avec des collections et des marqueurs.

Les collections permettent d'organiser hiérarchiquement les documents en groupes et sous-groupes. Un même document peut appartenir à plusieurs collections et sous-collections de votre bibliothèque en même temps. Les collections sont utiles pour classer les documents dans des groupes significatifs (par exemple, les documents d'un projet particulier, provenant d'une source spécifique, sur un sujet spécifique ou pour un cours déterminé). Vous pouvez importer des documents directement dans une collection déterminée ou les ajouter à vos collections après les avoir importés dans votre bibliothèque.

Les marqueurs (souvent appelés “mots-clés” dans d'autres contextes) permettent de caractériser de manière détaillée un document. Vous pouvez marquer les documents en fonction de leurs sujets, de leurs méthodes, de leurs statuts, de leurs classements, ou même en fonction de votre propre flux de travail (par exemple, “a_lire”). Les documents peuvent avoir autant de marqueurs que vous le souhaitez, et vous pouvez filtrer votre bibliothèque (ou une collection déterminée) pour afficher les documents ayant le même ensemble de marqueurs.

Les marqueurs sont portables, mais les collections ne le sont pas. Lorsque vous copiez des documents entre des bibliothèques Zotero (“Ma bibliothèque” et des bibliothèques de groupe) leurs marqueurs seront transférés, mais non leur emplacement dans des collections. Ces deux méthodes d'organisation présentent des avantages et des caractéristiques qui leur sont propres. Expérimentez les deux pour voir ce qui fonctionne le mieux pour votre flux de travail personnel.