모바일 기기를 위한 Zotero의 공식 앱은 없지만 몇몇 third party 툴을 활용할 수 있다.

• ZotPad, by Mikko Rönkkö.
  • 아이패드에서 내 라이브러리와 첨부파일을 볼 수 있다.
• BibUp, by Centre NTE (Université de Fribourg).
  • 아이폰/아이패드로 ISBN 바코를 스캔하여 Zotero 라이브러리에 책을 아이템으로 추가할 수 있다.

• Zandy, by Avram Lyon.
  • 안드로이드 기기에서 내 라이브러리를 보거나 수정할 수 있다.
• Scanner for Zotero, by John M. Schanck.
  • 모바일 기기로 ISBN 바코드를 스캔하여 내 라이브러리에 책을 아이템으로 추가할 수 있다.

• Zotfile, by Joscha Legewie.
  • Zotero plugin to sync PDFs from your Zotero library to your (mobile) PDF reader (e.g. an iPad, Android tablet, etc.) and extract annotations to Zotero notes.