多くのZoteroの機能はZotero「設定」画面を通じてカスタマイズすることができます。Zoteroの「設定」画面を開くには、Zoteroを開いて左列の上にあるactions メニューボタン (歯車のアイコン)を押して「設定」を選ぶか、あるいはFirefoxのツール・メニューから「アドオン」を選び、Zoteroを選んで「設定」ボタンをクリックしてください。
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設定画面における設定は以下のタブによって分類されています。
さらに高度な設定を行い隠れた機能を使うこともできます。